Il Centro Studi "S.Francesco" è stato fondato ed inaugurato presso la Comunità S. Francesco nel 1992 in collaborazione con il prof. Vladimir Hudolin (+1997), ideatore e promotore dei Club Alcologici Territoriali (CAT).
L'area primaria di interesse e di approfondimento del Centro Studi sono i problemi alcol droga correlati. Accanto a questa è andata negli anni intensificandosi la ricerca sulla Spiritualità Antropologica e sull'Ecologia Sociale, in coerenza con i programmi della stessa Comunità.
Il Centro Studi coopera con i programmi del Club Alcologici Territoriali Italiani (AICAT) e mondiali (WACAT) per contribuire a sviluppare un corretto e coerente approccio alla multidimensionalità e multifattorialità della sofferenza personale e famigliare causata dall'uso di sostanze psicoattive.
Il Centro promuove una riflessione sull'etica del servizio di tutte le persone coinvolte nei programmi di attenzione alla persona e collabora alla formazione e aggiornamento di quanti operano sul fronte della multidimensionalità del disagio alcol/droga correlato e comportamentale, all'interno e all'esterno della Comunità S. Francesco.
Nel tempo il Centro ha promosso a Monselice il Corso "Il Club e la multidimensionalità della sofferenza" (1992); una settimana di sensibilizzazione sui problemi alcol correlati e complessi per sacerdoti e religiosi (Padova 1994) , ha curato la pubblicazione del volume di V. Hudolin "Sofferenza multidimensionale della famiglia" (1995).
Il Centro Studi approfondisce e propone tematiche relative alla spiritualità antropologica come parte complementare e necessaria di un approccio al benessere della persona e della famiglia, soprattutto organizzando e conducendo ininterrottamente (1993-2010) , un congresso annuale di Spiritualità antropologica e di Ecologia sociale ad Assisi, in cooperazione con l' AICAT.
Nell'ordinario il Centro elabora, super vede e condivide l'approccio della Comunità S. Francesco rispetto a tutte le fasi del programma residenziale e semiresidenziale della Comunità S. Francesco, secondo le esigenze e le opportunità, in collaborazione con tutte le professionalità operanti, allo scopo di garantire a tutto il sistema la necessaria coerenza e armonizzazione tra le parti.